1995年，三谷幸喜与女演员小林聪美因戏结缘并成婚。2011年5月23日，三谷幸喜发联合声明，宣布两人在已正式办理离婚手续，并表示离婚是“为了可以将对彼此的尊敬继续保持下去，选择按照自己的方式分开生活”。
1988年，三谷幸喜编写个人第一部电视连续剧《还是喜欢猫》，同时还写了特别篇。
1991年，编写喜剧片《12个温柔的日本人》，获得"日本映画脚本赏"。1993年，编写由岩松节朗、河野圭太、木下高男联合执导的医疗剧《回首又见他》，该剧由织田裕二、石黑贤合作主演。
1994年，编写由田村正和、西村雅彦搭档主演的推理剧《古畑任三郎》。1995年，编写以一家面临经营危机的餐厅为主的励志片《奇迹餐厅》。1996年3月，编写推理剧《古畑任三郎2》。
1997年，三谷幸喜执导以政治为主题的火曜剧《别叫我总理》。11月，编导由唐泽寿明、田中邦卫合作主演的喜剧片《爆肚风云》，获得第48届柏林国际电影节堂吉诃德奖-特别提及。
1999年，编写推理剧《古畑任三郎第三季》。2000年，编写音乐舞台剧《OKEPI》和侦探悬疑剧《恰当言语的勇气》。2001年，执导以富裕生活为背景的喜剧片《大家的家》，获得第25届日本电影学院奖最佳导演和最佳编剧提名。
2002年，编写爱情喜剧片《坂本龙马，他的妻子和她的情人》，获得第26届日本电影学院奖最佳编剧提名。
2004年，编写由役所广司、稲垣吾郎合作主演的喜剧片《笑之大学》。同年，编写由清水一彦，伊势田雅也联合执导的大河剧《新选组》，该片由香取慎吾、藤原龙也联手主演。
2006年，执导第三部电影——喜剧片《有顶天酒店》，该片由役所广司、松隆子搭档主演。
2008年，三谷幸喜拍摄了由佐藤浩市、妻夫木聪合作主演的喜剧片《魔幻时刻》，该片获得了第32届日本电影学院奖最佳影片提名。
2009年底，为富士电视台台庆编写了家庭片《我家的历史》。2010年春，参演了世界奇妙物语20周年春季特别篇。
2011年10月，执导由深津绘里、西田敏行联袂主演的喜剧片《了不起的亡灵》，获得第35届日本电影学院赏最佳导演和最佳编剧提名。11月，执导仅由一个镜头组成的喜剧片《人生小节》。
2013年11月，执导以日本战国时代为背景的历史片《清须会议》，该片由役所广司、大泉洋搭档主演，获得第37届日本电影学院奖最佳导演和最佳编剧提名。12月，执导以机场工作人员大河内千草为主线的喜剧片《大空港2013》。
2014年，编写由河野圭太执导的推理悬疑片《东方快车谋杀案》。
2015年10月，三谷幸喜自编自导的第七部电影《银河街道》，该片以2265年的宇宙空间为舞台，由香取慎吾、绫濑遥合作主演。
2019年，执导第八部作品，由中井贵一主演的《失忆了！》。